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Re: PCR virtuelle



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Re: PCR virtuelle

   
Sujet: Re: PCR virtuelle
De: jerrym_1995 (l' arobase) yahoo.fr (Jerry M)
Groupes: fr.bio.genome
Organisation: Et la marmotte, elle enroule les deux brins
Date: 07. May 2004, 12:43:54
On Fri, 07 May 2004 13:02:37 +0200, Charles Plessy <plessy@igbmc.u-
strasbg.fr> wrote:

Guillermito wrote:

Tu es sûr de tes estimations? 100.000 euros pour un mutant
particulier de souris, ça me parait beaucoup.

C'est un chouilla surestimé. À l'époque, j'avais entendu des
chiffres de l'ordre de 500 000F. Pour arriver à une telle somme,
je crois qu'il faut réfléchir en «couts réels» : non seulement
les produits (enzymes, kits, souris), mais aussi le coût horaire
des chercheurs, techniciens et animaliers (production de cellules

Et, très très important, les frais de voyage aux congrès de l'autre
bout du monde... :-)

ES, service de microinjection, ...), ainsi que le coût de
maintenance (beaucoup de PCRs, maintien de la lignée,
entretien d'une animalerie stérile, animaux sentinelles,

Qu'est-ce que c'est que les animaux sentinelles? Par exemple des chats que
l'on met au piquet aux portes des animaleries et à côté des aquariums?

Pour revenir aux logiciels scandaleux, quelqu'un connaîtrait-il une *bonne*
alternative à Sequencher? Par *bonne* je veux dire qui ferait les mêmes
choses (pas comme Editview, Chromas, FinchTV, etc. qui n'assemblent pas de
contigs et/ou n'alignent pas les chromatogrammes), mais qui ne coûterait
pas la peau des fesses (voire plus) comme ceci:

 The current prices for Sequencher are as follows

 MACINTOSH
 Academic, Stand alone    US$ 2550,00 per copy
 Academic, Networked      US$ 2950,00 per concurrent user

 WINDOWS
 Academic, Stand alone    US$ 3350,00 per copy
 Academic, Networked      US$ 3850,00 per concurrent user

 These are academic prices and include the academic discount which
 represents a saving of some 30% over normal prices. Shipping is
 extra.

Ces tarifs "très avantageux" se justifient peut-être pour des labos qui
séquencent des Mpb par mois à bouchées doubles, mais pour la très grande
majorité des autres qui ne faisons du séquençage qu'une routine comme une
autre et non pas un but en soi, ils sont tout simplement prohibitifs.

Alternativement, j'ai examiné le format des fichiers ABI et il me semble
que ce ne serait pas très sorcier d'écrire un programme similaire à
Sequencher. Quelqu'un sait-il s'il existe un projet open source à ce sujet?

  JM
--
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Date Sujet  Auteur
04.05. * PCR virtuelleCharles Plessy
05.05. `* Re: PCR virtuelleP.Ferrandon
05.05.  `* Re: PCR virtuelleCharles Plessy
05.05.   +* Re: PCR virtuelleSeb
05.05.   |+* Re: PCR virtuelleJerry M
06.05.   ||+* Re: PCR virtuelleSeb
06.05.   |||`* Re: PCR virtuelleJerry M
06.05.   ||| `- Re: PCR virtuelleCharles Plessy
06.05.   ||`- Re: PCR virtuelleP.Ferrandon
06.05.   |`- Re: PCR virtuelleCharles Plessy
06.05.   `* Re: PCR virtuelleP.Ferrandon
06.05.    `* Re: PCR virtuelleCharles Plessy
06.05.     `* Re: PCR virtuelleP.Ferrandon
06.05.      `* Re: PCR virtuelleCharles Plessy
06.05.       +* Re: PCR virtuelleP.Ferrandon
07.05.       |`- Re: PCR virtuelleCharles Plessy
06.05.       `* Re: PCR virtuelleGuillermito
07.05.        `* Re: PCR virtuelleCharles Plessy
07.05.         `* Re: PCR virtuelleJerry M
07.05.          `* Re: PCR virtuelleCharles Plessy
07.05.           `* Re: PCR virtuelleJerry M
11.05.            `- Re: PCR virtuelleCharles Plessy
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