Jerry M wrote:

In article <4098f910$0$431$636a15ce@news.free.fr>,

Pour renseignement, ne serait-il pas possible de choisir simplement
ces amorces en vérifiant leurs spécificités par un alignement sur
le génome? Si les amorces sont uniques, elles n'amplifieront qu'un
seul fragment d'adn, non?

Non, parceque vous avez mal compris la question de P.Ferrandon, qui
est
universelle, sans compter qu'à la place d' "uniques" vous auriez
mieux fait de
redonder avec le terme de "spécifiques", ce qui n'arrange vraiment
pas les choses.

Unique devrai revenir au même si on considère qu'on travaille uniquement
sur un seul organisme. Spécifique serai plus adapté pour une séquence
que l'on trouve uniquement sur le poisson zèbre. Or, dans le cas présent,
je suppose que la PCR ne se faisant que sur de l'adn issu de cet organisme,
l'unicité est suffisante pour assurer également la spécificité.

Et d'ailleurs, vous semblez totalement ignorer les inconvénients
-sans parler du
manque total d'élégance- qu'implique le fait de devoir charger un
genome entier
dans la RAM.

Pourquoi le charger en mémoire alors que des serveurs spécifiques
au poisson zèbre sont disponibles (blast, probablement entre autre)?
De plus, rien ne dit que Charles Plessy ne dispose pas de ressources
nécessaires pour travailler en local sur le génome du poisson zèbre.