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Re: Outils de contigage et d'alignement...



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Re: Outils de contigage et d'alignement...

   
Sujet: Re: Outils de contigage et d'alignement...
De: Sebastien.Moretti (l' arobase) igs.cnrs-mrs.fr (Sebastien Moretti)
Groupes: fr.bio.biolmol
Organisation: CNRS - IGS
Date: 01. Mar 2004, 13:17:17
Bonjour,
pour le contigage, il y a encore CAP3, Tigr_Assembler ou LASSAP (base sur
CAP3 avec des options pour l'apres contigage mais qui n'est pas gratuit).
Pour la comparaison de sequences, il y a BLAST, FASTA, ....

Bonjour à tous,

Je suis à la recherche de noms d'outils permettant à la fois le contigag
e de séquences expérimentales et la comparaison de la séquence obtenue a
vec une séquence théorique(Des outils qui feraient le même boulot que PH
RED/PHRAP/CONSED).

D'avance merci.

--
Sebastien MORETTI
CNRS - IGS



Date Sujet  Auteur
01.03. * Outils de contigage et d'alignement...BNJ
01.03. +- Re: Outils de contigage et d'alignement...Sebastien Moret
01.03. +- Re: Outils de contigage et d'alignement...Charles Plessy
02.03. `- Re: Outils de contigage et d'alignement...Nico
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