Bonjour,
Le Centre des Enseignements de l'Institut Pasteur organise un cours
d'Informatique en Biologie dont la prochaine session aura lieu de janvier
à fin avril 2005.
Ce cours a pour objectif de donner à des chercheurs en biologie de niveau
minimum Bac+4 ou équivalent une formation initiale à l'informatique.
L'introduction dans l'activité des biologistes d'outils informatiques de plus en
plus nombreux rend importante l'acquisition par les chercheurs de compétences qui
leur permettent d'une part de traiter leurs données ou de mettre en oeuvre leurs
modèles, et d'autre part de juger les systèmes et les algorithmes disponibles.
L'accent est mis sur les aspects fondamentaux de la discipline et l'apprentissage
de la programmation, mais de nombreuses applications à la biologie sont étudiées, à
travers des exemples et des exercices pratiques. Les aspects théoriques sont
enseignés, à travers l'algorithmique, la logique et la modélisation de problèmes,
ainsi que les méthodes de conception. Les domaines techniques tels que les bases
de données et les technologies du Web sont également développés.
La programmation est enseignée selon le paradigme objet, à travers un langage moderne
de haut niveau, Python, disposant d'outils pour la biologie et permettant tout autant
le prototypage ou l'écriture de scripts que la construction de systèmes informatiques
importants. L'enseignement de langages complémentaires, tels que perl ou C, sera
assuré en option.
Certains sujets, en algorithmique biologique par exemple, font l'objet de
séminaires (voir ci-dessous).
La mise en pratique et l'acquisition effective des connaissances sont favorisées
par des TP sur machine et par un stage-projet s'étalant 2 mois. Le sujet du
stage-projet fait l'objet d'un choix concerté entre l'élève, les enseignants et
un tuteur. Le tuteur peut être un des enseignants du cours ou un bio-informaticien
du campus. Des sujets prédéfinis sont également proposés par les enseignants ou
par les tuteurs. Ce stage est réalisé dans la salle de T.P.
Pour plus d'informations sur le cours et pour les modalités d'inscription, consulter :
http://www.pasteur.fr/formation/infobio.html
** Attention : cloture des inscriptions : fin septembre 2004 **
Séminaires :
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Les séminaires sont ouverts à tous, et ne nécessitent pas d'inscription au cours. Il
serait cependant utile de prévenir de votre participation éventuelle, afin de pouvoir
prévoir les locaux adéquats.
Dates des séminaires :
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De mi-mars à fin-avril (les dates et les conférenciers seront spécifiés
ultérieurement).
Cordialement,
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Catherine Letondal -- Institut Pasteur -- Pôle Informatique
